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Con el transcurrir de los años, las personas y las entidades más representativas de su tiempo, así como organismos oficiales y corporaciones académicas, quisieron rendir homenaje a tan destacada labor en el campo de la cultura, las artes y la sociedad en general. Así en 1889, el Archiduque fue nombrado miembro honorario de la Academia Imperial de Ciencias de Viena y la Sociedad Geográfica de esta ciudad le concedió en 1898 la Medalla Hauer, premio a su labor en el terreno de las exploraciones geográficas; fue envestido Presidente honorário de la Sociedad húngara de Geografía y además era Socio Perpetuo de la Sociedad de Espeleología de París, Socio honorario de la Sociedad Geográfica Peruana de Lima, Miembro honorario de la Academia de Ciencias, Letras y Artes de Bohemia, Socio Protector del Club Alpino Siciliano, Miembro honorario del Touring Club de Bélgica y Académico Honorario de la Real Academia de la Historia de Madrid. En 1883 fue nombrado Académico Honorario de la Academia Provincial de Bellas Artes de Palma de Mallorca, y en 1887, la Diputación Provincial de Baleares le nombró Hijo Adoptivo de esta provincia. En 1909, la Sociedad para el Fomento del Turismo de Mallorca le nombró Presidente Honorario. En 1910, el ayuntamiento de Palma le proclamó Hijo Ilustre de Mallorca. Y por último, la ciudad de Soller le proclamó en 1913 Hijo Adoptivo por ceder unos terrenos para uso ferroviario algo que quedó en proyecto-. En 1915, murió en el castillo de Brandais, en Austria, habiendo nombrado en testamento como heredero universal de todos sus bienes a don Antonio Vives y Colom (secretario personal, colaborador y hombre de su confianza que conoció en Mallorca y que le acompañó desde 1872 hasta su muerte) y a sus hijos. Palma de Mallorca bautizó con el nombre de Arxiduc Luis Salvador la calle más importante del Ensanche de la ciudad a principios del siglo XX, y en 1953 se levantó un gran obelisco en una plaza que atraviesa con un bajorrelieve de temática mitológica a la memoria de su imagen renacentista. Prolífico descriptor de sus entornos, de su vida y de su amor mallorquín, Catalina Homar, pagesa que empezó trabajando para él y que acabó convirtiéndose en la Madona de SEstaca, destaca entre sus publicaciones, más de cincuenta, Die Balearen in Wort und Bild, monumental obra que consta de varios tomos, en la que describe como nadie la gran magnificencia de un archipiélago todavía virgen, poblado tan sólo por sus habitantes y por algún viajero ocasional, incapaz de volver a su tierra maravillado por lo que allí encontró.